Lors du baptême de Charles Quint en 1500, la transformation de cette église résolument romane en grande cathédrale gotique battait encore son plein. Malgré l’important soutien financier de l’empereur, la cathédrale était encore inachevée 58 ans plus tard. Aucun service funèbre n’a donc pu y être organisé pour le souverain décédé.
Aujourd’hui, seule la crypte subsiste de l’église romane initiale. Le nombre de trésors artistiques que recèle la Cathédrale Saint-Bavon est impressionnant: le maître-autel baroque en marbre moiré de noiret blanc et de rouge, la chaire rococo en chêne, bois doré et marbre, une magnifique œuvre de Rubens, le triptyque du Calvaire attribué à Joos van Wassenhove, alias Juste de Gand, des mausolées d’évêques gantois, etc. Cependant, l’une de ces oeuvres se détache: le mondialement célèbre 'Agneau Mystique' d’Hubert et Jan van Eyck datant de 1432.